Konjuge pnömokok aşısı uygulaması sonrası çocuklarda invaziv pnömokok hastalığı sıklığı, serotip dağılımı ve antibiyotik direnci
| dc.contributor.advisor | İnce, Erdal | |
| dc.contributor.author | Ekin, Nihal | |
| dc.contributor.department | Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları | tr_TR |
| dc.date.accessioned | 2024-03-22T13:47:55Z | |
| dc.date.available | 2024-03-22T13:47:55Z | |
| dc.date.issued | 2020 | |
| dc.description.abstract | Streptococcus pneumoniae, yaygın aşılama programlarına rağmen, enfeksiyon hastalıkları ile ilişkili ölümlerin en önemli nedenlerindendir. İlk olarak 2000 yılında yedi bileşenli konjuge pnömokok aşısı (KPA), ardından 2009'da KPA10 ve 2010'da KPA13 üretilmiş ve birçok ülkenin ulusal aşı takviminde yerlerini almışlardır. Bu aşıların uygulamalarından sonra tüm dünyada İPH insidansında ve antibiyotik direncinde azalma görülmüştür. Türkiye'de ilk olarak KPA7 Ekim 2005' de ruhsat almış, Nisan 2011 tarihinden sonra KPA13 Ulusal Aşı Takviminin bir parçası olmuştur. Dünyanın diğer bölgelerinde olduğu gibi Türkiye'de de aşı uygulaması sonrasında İPH insidansında azalma, aşı kapsamındaki serotiplerle ilişkili invaziv hastalıklarda azalma, İPH neden olan serotiplerin aşı dışı serotipler lehine değişimi ve antibiyotik direnç oranlarında düşme olması beklenmektedir. Bu çalışma, KPA13 uygulaması sonrası ülkemizdeki pnömokok epidemiyolojisindeki değişimleri belirlemek ve gelecekteki aşı çalışmalarına yol gösterici olması amacıyla yapılmıştır. Çalışma, Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi (AÜTF) Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, AÜTF Çocuk Enfeksiyon Hastalıkları Bilim Dalı, AÜTF Cebeci Hastanesi Merkez Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Türkiye Halk Sağlığı Kurumu Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarları Daire Başkanlığı Ulusal Solunum Yolu Patojenleri Referans Laboratuvarı ve Ulusal Moleküler Mikrobiyoloji Referans Merkez Laboratuvarı'nda retrospektif olarak yürütüldü. Ekim 2009 ile Ekim 2019 tarihleri arasında AÜTF Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Genel Pediatri Polikliniği ve Acil Polikliniğine başvuran 0-18 yaş arasındaki çocuklardan invaziv pnömokok hastalığı tanısı alanlar çalışmaya dahil edildi. Pnömokok suşlarının penisilin ve sefotaksime karşı duyarlılığı E-test yöntemi ile Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) kriterleri temel alınarak belirlendi. İzolatlar Quellung reaksiyonu veya PCR yöntemi ile serotiplendirildi. Çalışma süresince 50 çocuğa invaziv pnömokok hastalığı tanısı konuldu. Altı hastada invaziv pnömokok hastalığı için risk oluşturan hastalık bulunmaktaydı. Bu hastalar dışında invaziv pnömokok hastalığı teşhisi konulan 6 hastada laboratuvardaki teknik nedenler nedeniyle serotip ve antibiyotik direnci değerlendirilemedi. Sadece önceden sağlıklı olan hastalardan elde edilen verilerle hastalık yaş dağılımı, hastalık insidansı ve serotip analizleri belirlendi. Önceden sağlıklı olan 44 hasta değerlendirildiğinde hastalardan 27 tanesi (%61,3) 2 yaş ve altında, 11 tanesi (%25) 2-5 yaş arasında, 6 tanesi (%13,7) 5 yaş üstündeydi. Bu sonuçlar İPH'ın halen 5 yaş altı çocuklarda daha yaygın olduğunu göstermektedir. Beş yaş altındaki çocuklar hastalık tipine göre değerlendirildiğinde, 30 (%79) hasta gizli bakteriyemi/sepsis, 8 (%21) hasta pürülan menenjit tanısı almıştır. Önceden sağlıklı olan 5 yaş üstü hastaların 5'i menenjit ve 1 tanesi bakteriyemi tanısı aldı. Çalışma süresince 5 yaş altı sağlıklı çocuklarda yıllık invaziv pnömokok hastalığı sıklığının, 2009 yılında 100.000 hastane başvurusunda 9,35'ten 2019'da 100.000 hastane başvurusunda 0,83'e anlamlı olarak azaldığı görülmüştür (p<0.001). Bu sonuçlar rutin aşı uygulaması sonrası invaziv hastalıkların görülme sıklığının azalacağı hipotezimizi desteklemektedir. Araştırmamızda serotipleme analizleri, KPA7 ve KPA13'ün rutin uygulamaya girdiği tarihlere göre ayrılarak değerlendirilmiştir. Çalışma süresi boyunca KPA7 serotipleri ve KPA13 serotipleri sırasıyla %28,9 (11/38) ve %44,7 (17/38) oranında görülmüştür. En sık saptanan serotipler, 19F (6 hasta), 23F (4 hasta) ve 7F (3 hasta), 31 (2 hasta) ve 24B (2 hasta) idi. KPA13 döneminde, tam aşılı 3 çocukta KPA13 kapsamında olan 19F serotipinin neden olduğu İPH görüldü. Çalışmamızdaki aşı dışı serotiplerin oranı ise KPA7 döneminde %54,5 (6/11), KPA13 döneminde %70,3 (19/27) olarak saptanmıştır. Aşı dışı serotiplerin oranı zaman içinde arttığı görüldü ancak bu artış istatiksel olarak anlamlı değildi (p= 0,557). Araştırmamızda KPA7 dönemindeki İPH'larda görülen KPA13 serotiplerinin oranı %81,8 (9/11) iken, KPA13 uygulaması sonrası 8 yıl içinde bu oran %29,6'ya (8/27) gerilemiştir. KPA7 döneminde saptanan serotiplerin 5'i (%45,5) 7 bileşenli, 9'u (%81,8) 13 bileşenli aşı tarafından kapsanmaktadır. Bu zaman diliminde görülen serotiplerden 2 (%18,1) tanesi hem KPA7 hem de KPA13 tarafından kapsanmıyordu. Ayrıca KPA7 döneminde görülen bu 2 aşı dışı serotip KPA15 ve KPA20'nin içeriğinde de yer almamaktadır. KPA13 döneminde saptanan izolatların 8'i (%29,7) 13 değerlikli aşı tarafından kapsanmaktadır. Bu dönemde KPA13 tarafından kapsanmayan 19 (%70,3) serotip belirlenmiştir. KPA13 tarafından kapsanmayan bu serotiplerin 1 (%5,2) tanesi KPA15, 5 (%26,3) tanesi KPA20 tarafından kapsanmaktadır. Çalışma periyodu boyunca tüm hastalarda aşı kapsama oranları incelendiğinde KPA7'nin serotip kapsama oranı %28,9 (11/38), KPA13' ünse %44,7 (17/38) olarak belirlenmiştir. Bu süreçte KPA15'in serotip kapsama oranı %47,3(18/38), KPA20'ninse %57,8 (22/38) olacağı saptanmıştır. Çalışmaya alınan 44 izolattan ikisi PCR ile saptandığı için, 1 tanesi de laboratuvardaki teknik nedenlerden dolayı antibiyotik duyarlılığı açısından incelenemedi. Nonmeningeal enfeksiyona göre penisilin ve seftriakson MİK değerleri incelendiğinde izolatların tümünün duyarlı olduğu bulundu. Meningeal enfeksiyona göre penisilin MİK değeri incelendiğinde 18 (%43,9) hastanın dirençli, seftriakson MİK değerine göre ise 4 (%9,75) hastanın dirençli olduğu belirlendi. KPA7 tarafından kapsananlar penisilin (meningeal enfeksiyona göre) duyarlılıkları açısından değerlendirildiğinde, izolatların 7'si (%70) penisilin dirençli, KPA13 tarafından kapsananların 7'si (%43,7) penisilin dirençliydi. Penisilin direnci görülen izolatlar içerisinde en sık 19F (4 izolat) ve 23F (3 izolat) serotipleri belirlendi. Aşı dışı serotiplerin penisilin direnç oranıysa %44,4 (8/18) olarak belirlendi. Çalışma periyodumuz 2009-2014 ve 2015-2019 olarak iki döneme ayrılıp beş yaş altı çocuklarda meningeal enfeksiyona göre penisilin ve seftriakson direnç oranları belirlendi. İki dönem arasında antibiyotik direnci açısından anlamlı bir fark bulunmadı. Sonuç olarak, çalışmamız tek merkezli olsa bile, KPA13 uygulaması sonrası 5 yaş altı çocuklarda invaziv pnömokok hastalığının sıklığında azalma olduğunu göstermiştir. Çalışmamızda aşı içeriğindeki serotiplerin oranı azalırken, aşı dışı serotiplerde artış olduğu belirlendi. Ancak diğer birçok ülkeden farklı olarak, aşı dışı serotiplerden 22F ve 33F'de artış izlenmedi. Çalışmamızda antibiyotik direnç oranlarında yıllara göre belirgin bir değişim görülmedi. | tr_TR |
| dc.description.ozet | Streptococcus pneumoniae, despite widespread vaccination programs, is one of the most important causes of death associated with infectious diseases. Therefore, 7- Valent Pneumococcal Conjugated Vaccine (PCV7), 10-Valent Pneumococcal Conjugated Vaccine (PCV10) and 13-Valent Pneumococcal Conjugated Vaccine (PCV10), which were produced respectively in 2000, 2009 and 2010, have taken their places in national immunization programmes of many countries. After the vaccination there has been decrease in the incidence of Invasive Pneumococcal Disease (IPD) and antibiotic resistance worldwide. In Turkey, primarily PCV7 received certificate in October 2005 and lastly PCV13 became a part of our national immunization programme in April 2011. As in other parts of the world also in Turkey after vaccination, it is expected that there will be a decrease in the incidence of IPD, a reduction in invasive diseases associated with vaccine serotypes, change of serotypes causing IPD in favor of non-vaccine serotypes and a decline in antibiotic resistance rates. This study was conducted to determine the changes in the epidemiology of pneumococcus in our country after PCV13 and it aimed to guide future vaccine studies. This study was conducted as a retrospective research project in collaboration of Department of Paediatrics, Department of Paediatric Infectious Diseases and Cebeci Hospital Microbiology Laboratory at Ankara University Medical School, and National Reference Microbiology Laboratory for Respiratory Pathogens, and Molecular Microbiology Reference Laboratory at Public Health Association Turkish Ministry of Health. The patients included the study were chosen among the children aged 0-18 years who applied Ankara University Medical School's Department of Paediatrics or Emergency Department in between October 2009- October 2019 and were diagnosed with invasive pneumococcal disease. The susceptibility of pneumococcal strains to penicillin and cefotaxime was determined by E-test method based on Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) criteria. The isolates were serotyped by Quellung reaction or PCR method. During the ten-year period focused in the study, 50 children were diagnosed with invasive pneumococcal disease. Six of these children had underlying diseases that posed a risk for invasive pneumococcal disease. In 6 of the remaining 44 patients, serotype and antibiotic resistance could not be evaluated due to technical problems in the laboratory. Disease age distribution, disease incidence and serotype analysis were determined with the data obtained from previously healthy patients. Of the 44 previously healthy patients, 27 (61.3%) were under 2 years of age, 11 (25%) were between 2-5 years of age, and 6 (13.7%) were over 5 years of age. These results suggest that IPD is still more common in children under 5 years of age. Evaluation made according to type of disease showed that 30 (79%) of children under 5 years were diagnosed with occult bacteremia / sepsis and 8 (21%) had purulent meningitis. On the other hand, 5 of the previously healthy patients over 5 years of age were diagnosed with meningitis and 1 with bacteremia. In 2009, the incidence of invasive pneumococcal disease among healthy children under 5 years of age was 9,35 for 100,000 hospital admissions, but it decreased significantly to 0.83 in 2019 (p <0.001). These results support our hypothesis that the incidence of invasive diseases will decrease after routine vaccination. In our study, serotyping analyzes were evaluated according to the dates when the PCV7 and PCV13 were routinely applied. During the study period, the PCV7- serotypes and the PCV13-serotypes were 28.9% (11/38) and 44.7% (17/38), respectively. The most common serotypes were 19F (6 patients), 23F (4 patients) and 7F (3 patients), 31 (2 patients) and 24B (2 patients). In the PCV13 period, three fully vaccinated children had IPD caused by serotype 19F covered by PCV13. The rate of non-vaccine serotypes in our study was 54.5% (6/11) in the PCV7 period and 70.3% (19/27) in the PCV13 period. The proportion of non-vaccine serotypes increased over time, but this increase was not statistically significant (p = 0.557). Our study showed that the rate of PCV13 serotypes seen in IPDs was 81.8% (9/11) in the PCV7 period, but it decreased to 29.6% (8/27) within 8 years after PCV13 vaccination. While 5 (45.5%) of the serotypes detected in the PCV7 period were covered by PCV7, 9 of them (81.8%) were covered by PCV13; but 2 (18.1%) of the serotypes seen in this time period were covered by neither PCV7 nor PCV13. In addition, these 2 non-vaccine serotypes seen in the PCV7 period are not included in the content of PCV15 and PCV20. Of the isolates detected in the PCV13 period, 8 (29.7%) were covered by 13 valent vaccines. In this period, 19 (70.3%) serotypes that not covered by PCV13 were detected. One (5.2%) of these serotypes was covered by PCV15 and 5 (26.3%) of them were covered by PCV20. When the vaccine coverage rates were examined in all patients during the study period, serotype coverage rate of PCV7 was determined as 28.9% (11/38) and 44.7% (17/38) of PCV13. In this process, the serotype coverage rate for PCV15 was found to be 47.3% (18/38) and 57.8% (22/38) for PCV20. In consequence of two isolates were detected by PCR method and one isolate exposed some technical problems in the laboratory, three of the 44 isolates that the study includes could not be examined for antibiotic susceptibility. Evaluation of penicillin and ceftriaxone MIC values according to non-meningeal infection showed that all of the isolates were susceptible to penicillin and ceftriaxone. When MIC values were evaluated according to meningeal infection, it was seen that 18 (43.9%) patients were resistant to penicillin and four (9.75%) patients were resistant to ceftriaxone. Penicillin susceptibility evaluation of isolates covered by vaccines according to meningeal infection indicated that seven (70%) of those covered by PCV7 and seven (43.7%) of those covered by PCV13 were resistant to penicillin. Among the isolates with penicillin resistance, the most common serotypes were 19F (4 isolates) and 23F (3 isolates). Penicillin resistance rate of non-vaccine serotypes was 44.4% (8/18). Our study period was divided into two periods as 2009-2014 and 2015-2019, and penicillin and ceftriaxone resistance rates were determined in children under five years of age according to meningeal infection. There was no significant difference in antibiotic resistance between the two periods. In conclusion, even if it was a single-center study, it showed that the incidence of invasive pneumococcal disease decreased in children under 5 years of age after PCV13 vaccination. In our study, it was determined that the ratio of serotypes in vaccine content decreased while non-vaccine serotypes increased. However, unlike many other countries, there was no increase in the non-vaccine serotypes 22F and 33F. In our study, no significant change in antibiotic resistance rates over the years was observed. | tr_TR |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12575/90654 | |
| dc.language.iso | tr | tr_TR |
| dc.publisher | Tıp Fakültesi | tr_TR |
| dc.subject | Antibiyotikler | tr_TR |
| dc.subject | Aşılama | tr_TR |
| dc.subject | Aşılar | tr_TR |
| dc.title | Konjuge pnömokok aşısı uygulaması sonrası çocuklarda invaziv pnömokok hastalığı sıklığı, serotip dağılımı ve antibiyotik direnci | tr_TR |
| dc.title.alternative | Prevalence, serotype distribution and antibiotic resistance of invasivepneumococcal disease after 13-valent pneumococcal conjugated vaccine | tr_TR |
| dc.type | MedicalThesis | tr_TR |