Salmonella enterica subspecıes enterica serovar ınfantıs suşlarında çoklu ilaç dirençliliğinin genetik doğası
No Thumbnail Available
Date
2011
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Ankara Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri
Abstract
Bu çalışmada, Ankara Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü Kültür Koleksiyonundan sağlanan Salmonella Infantis suşlarının çoklu ilaç dirençlilikleri genetik açıdan incelenmiştir. Salmonella suşlarında klonal yayılımın tespiti için kromozomal deoksiribonükleikasit (DNA) izolasyonu, ardından da XbaI restriksiyon enzimi ile kesim gerçekleştirilmiştir. XbaI fragment profillerine göre; S. Agona, S. Enteritidis, S. Thompson ve S. Wirchow tek, S. Kentucky ve S. subspecies I Rough form iki, S. Infantis üç ve S. Typhimurium dokuz farklı grup altında toplanmıştır. Çalışmada kullanılan 18 S. Infantis suşlarında ilaç dirençlilikleri kanamisin, neomisin, nalidiksik asit, tetrasiklin, spektinomisin, sulfonamid, trimetoprim, ampisilin, amoksisilin/klavulanik asit, seftiofur, kloramfenikol, florfenikol, gentamisin, siprofloksasin, trimetoprim/sulfometoksazol ve streptomisin olmak üzere 16 farklı antibiyotik tarafından incelenmiş ve DMC40 suşu dışındaki diğer S. Infantis suşlarının kanamisin, tetrasiklin, neomisin, spektinomisin, streptomisin, sulfonamit, nalidiksik asit ve trimetoprime, DMC40 suşunun ise kanamisin ve neomisin dışında diğer suşlar ile aynı antibiyotiklere direnç gösterdiği görülmüştür. Çoklu ilaç dirençlilik özelliğine sahip olduğu belirlenen ve dalgalı alan jel elektroforezi analizleri sonucu suş seviyesinde tanısı gerçekleştirilen S. Infantis üyelerinin plazmid profilleri her suş grubu için birden fazla örnek seçilerek araştırılmıştır. Plazmid analizleri sonucunda suşlarının tamamının 206.5 kilo baz (kb) büyüklükte tek plazmid içerdiği saptanmıştır. Plazmidin antibiyotik dirençlilik fenotipi ile ilişkisinin araştırılmasında plazmid giderme ve konjugal aktarım çalışmaları yapılmıştır. Plazmid giderme denemeleri sonuç vermemiştir. Konjugal aktarımda 3 S. Infantis grubunun temsilen 9 suş verici, karbenisilin dirençli S. Typhimurium MA1 suşu alıcı olarak kullanılmıştır. 206.5 kb‘lık plazmidin konjugasyon yolu ile aktarımı sonucunda nalidiksik asit dirençliliğin kazanımı gözlemlenmiştir. S. Infantis suşlarında nalidiksik asit dirençliliğin moleküler analizi için, gyrA antibiyotik direnç gen bölgesi incelenmiştir. Konjugatif plazmid üzerinde gyrA gen bölgesinde Ser83→Tyr (TCC→TAC) nokta mutasyonu tespit edilmiştir. S. Infantis suşları, konjugantlar ve S. Typhimurium MA1 suşunda yapılan sınıf 1 integron analizleri sonucunda, hepsinde 1200 baz çiftlik (bç), S. Infantis suşları ve konjugantlarda S. Typhimurium MA1 suşundan farklı olarak ilaveten 1000 bç’lik sınıf 1 integronlara ait farklılaşmış bölgeler elde edilmiştir. 1000 bç’lik sınıf 1 integronun nalidiksik asit direnciyle ilişkisi araştırılması amaçlı gyrA bölgesinin incelenmesi sonucu 1000 bç’lik sınıf 1 integron üzerinde de TCC→TAC nokta mutasyonu tespit edilmiştir.